روش های خطی و غیرخطی ارتباط کمی ساختار- فعالیت جهت پیش بینی فعالیت دارویی برخی از مشتقات آمینواسیدها

نویسندگان

مهدی نکویی

استادیار شیمی تجزیه، گروه شیمی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد شاهرود، شاهرود، ایران مجید محمدحسینی

دانشیار شیمی تجزیه، گروه شیمی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد شاهرود، شاهرود، ایران مهدی رحیمی

کارشناس ارشد شیمی فیزیک، گروه شیمی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد شاهرود، شاهرود، ایران عبدالرضا علوی قره باغ

مربی، دانشجوی دکترای برق، گروه برق، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد شاهرود، شاهرود، ایران

چکیده

این پژوهش به پیش بینی فعالیت دارویی 38 مشتق آمینواسید به عنوان بازدارنده های هیستون دی استیلاز (hdac) جهت درمان سرطان و برخی از بیماری ها اختصاص دارد. آنزیم های hdac موجب تسریع روند حذف گروه های استیل از باقیمانده های لیزین از پروتیین های شامل هیستون (histone) می شوند. پس از محاسبه ی توصیف کننده های مولکولی مستقل، با استفاده از روش مرحله ای انتخاب متغیر و گزینش 4 توصیف کننده، جهت مدل سازی از رگرسیون خطی چندگانه (mlr) و شبکه ی عصبی مصنوعی (ann) استفاده شد. سری های آموزش و آزمون جهت ساخت مدل و ارزیابی قدرت پیش بینی روش های mlr و ann به ترتیب شامل 30 و 8 ترکیب بودند. افزون بر آن، از روش های متفاوت جهت ارزیابی مدل ها استفاده شد. نتیجه ها حاکی از آن است که روش غیرخطی شبکه ی عصبی مصنوعی در مجموع دارای توانمندی پیش بینی مناسب تر در مقایسه با روش mlr است. شاخص های آماری مرتبط با مدل مبتنی بر شبکه ی عصبی مصنوعی دلالت بر این حقیقت دارد که مدل ارایه شده می تواند جهت پیش بینی فعالیت دارویی ترکیب های مشابه مورد استفاده قرار گیرد.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

روش‌های خطی و غیرخطی ارتباط کمی‌ساختار- فعالیت جهت پیش‌بینی فعالیت دارویی برخی از مشتقات آمینواسیدها

این پژوهش به پیش‌بینی فعالیت دارویی 38 مشتق آمینواسید به عنوان بازدارنده‌های هیستون دی استیلاز (HDAC) جهت درمان سرطان و برخی از بیماری‌ها اختصاص دارد. آنزیم‌های HDAC موجب تسریع روند حذف گروه‌های استیل از باقیمانده‌های لیزین از پروتیین‌های شامل هیستون (Histone) می‌شوند. پس از محاسبه‌ی توصیف‌کننده‌های مولکولی مستقل، با استفاده از روش مرحله‌ای انتخاب متغیر و گزینش 4 توصیف‌کننده، جهت مدل‌سازی از رگ...

متن کامل

پیش بینی فعالیت ضدسرطانی مشتقات ۱و۸- نفتیریدین توسط روش الگوریتم ژنتیک-رگرسیون خطی چندگانه

سابقه و هدف: این مطالعه به مقایسه مدل سازی QSAR فعالیت ضد سرطانی ترکیبات ۱و۴-دی هیدرو-۴-اکسو-۱-(۲-تیازولیل)-۱و۸-نفتیریدین و مشتقات آن با روش رگرسیون خطی چندگانه مرحله ای (S-MLR ) و روش الگوریتم ژنتیک-رگرسیون خطی چندگانه (GA-MLR) پرداخت. روش بررسی: مجموعه ای از ۱۰۰ ترکیب با فعالیت ضد سرطانی مشخص از مقاله معتبر بین المللی انتخاب شد و روش میدان نیروی آلینجر MM2 برای کمینه کردن انرژی مولکول­ها استف...

متن کامل

مطالعه روابط کمی ساختار- فعالیت برای پیش بینی فعالیت دارویی ضد ایدز مشتقات ایمیدازول

در این مطالعه مدل یابی فعالیت ضد ایدز وضد آروماتاز (بیماری سرطان سینه) مبتنی برساختار مولکولی برخی از ترکیبات مربوط به مشتقات ایمیدازول، پریمیدازول، فتالازینون و بنزآلفاتالید همچنین مشتقات تری آزول و ایمیدازول با استفاده از روابط کمی ساختارـ فعالیت مورد بررسی قرار گرفت. مطالعه برروی دو مجموعه اصلی شامل 42مولکول با فعالیت ضد ایدز و57 مولکول با فعالیت ضد آروماتاز(بیماری سرطان سینه) با ?50 حداقل ...

15 صفحه اول

پیش بینی فعالیت آنتی HIV یکسری از مشتقات PETT به عنوان بازدارند ه های غیرنوکلئوزیدی آنزیم نسخه بردار معکوس با استفاده از مدلهای QSAR خطی و غیرخطی

به منظور پیش بینی فعالیت آنتی HIV یکسری از مشتقات فنتیل تیازولیل تیواوره (PEET)، مدلهای ارتباط کمی ساختار- فعالیت (QSAR) با استفاده از توصیفگرهای محاسبه شده، ساخته شد. روش رگرسیون مرحله ای جهت کاهش تعداد توصیفگرهای (متغییرها) محاسبه شده توسط دراگون به گار گرفته شد. متغییرهای انتخاب شده سپس به عنوان ورودی برای تولید مدلهای QSAR با استفاده از رگرسیون خطی خطی چندگانه(MLR) و شبکه عصبی مصنوعی(ANN)...

متن کامل

کاربرد الگوریتم ژنتیک به همراه رگرسیون خطی چند گانه برای پیش بینی فعالیت دارویی مشتقات پیرازول ها

مطالعه ارتباط کمی ساختار- فعالیت برای پیش بینی فعالیت دارویی مشتقات پیرازول ها، با استفاده از توصیف کننده های ساختاری و روش رگرسیون خطی چند گانه توسعه داده شده است. توصیف کننده های مولکولی با استفاده از الگوریتم ژنتیک انتخاب شدند. سپس یک مدل ساده، قوی، قابل تفسیر و با خطای کم و ضریب همبستگی بالا ساخته شد. نتایج نشان می دهد که تکنیک های خطی مانند رگرسیون خطی چند گانه که با یک روش انتخاب متغیر من...

متن کامل

پیش بینی فعالیت برخی ترکیبات دارویی ضد اختلال خواب با استفاده از روش های خطی و غیرخطی qsar

در قسمت اول این تحقیق، مطالعات ارتباط کمی ساختار- فعالیت (qsar)، برای مدل سازی و پیش بینی فعالیت ضد اختلال خواب یکسری از ترکیبات دی هیدرو کینولین توسعه یافت. روش های رگرسیون مرحله ای (sr) و الگوریتم ژنتیک(ga) برای انتخاب توصیف کننده های مناسب استفاده شدند. توصیف کننده های انتخاب شده توسط این دو روش برای مدل سازی و پیش بینی فعالیت ضد اختلال خواب این ترکیبات وارد شبکه عصبی مصنوعی (ann) شدند. به م...

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید


عنوان ژورنال:
پژوهش های کاربردی در شیمی

جلد ۶، شماره ۴، صفحات ۵۳-۶۱

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023